O magnésio é usado pelos corais duros para a formação do seu esqueleto. Os seus níveis devem ser mantidos (aproximadamente três vezes mais a concentração do cálcio) entre 1350-1500ppm. A presença de magnésio previne a precipitação quer de cálcio, quer de alcalinidade, então níveis de magnésio no seu intervalo recomendado mantêm a estabilidade química destes parâmetros. Consequentemente a adição destes pode ser usada de forma a aumentar os níveis de magnésio conforme necessário. Assim como cálcio e alcalinidade, deve dosear a menos do que a mais, até encontrar os níveis ideais. É recomendado o teste deste, de forma a confirmar que o doseamento esteja a ser feito de forma correcta. Não é necessário dosear magnésio tão frequentemente como o cálcio ou alcalinidade, sendo que, por exemplo, uma ou duas doses semanais, normalmente, são o suficiente, caso o doseamento dos outros parâmetros seja feito diariamente.
