Oxigénio é tão essencial para os animais do aquário como para a vida humana. Os peixes absorvem o oxigénio dissolvido directamente da água para a sua corrente sanguínea, através das suas guelras. Embora algumas espécies, sejam capazes de respirar o oxigénio da atmosfera, níveis adequados de oxigénio devem sempre ser mantidos.

A quantidade de oxigénio que a água consegue reter (saturação) depende da temperatura, salinidade e pressão atmosférica. Quando a temperatura sobe, a quantidade de oxigénio que a água consegue reter diminui. Da mesma forma, assim que a salinidade aumenta, menos oxigénio pode ser dissolvido. A maiores pressões, a água consegue reter mais oxigénio.

O oxigénio dissolvido pode ser suplementado através do uso de um sistema de aeração. Em aquariofilia, este sistema consiste apenas de uma simples bomba de ar ou pedras de aeração. Embora este tipo de sistemas não aumente grandemente os níveis de oxigénio, pode quebrar a tensão da superfície da água e aumentar a taxa de difusão. Pequenas bolhas de ar, como aquelas formadas por uma pequena pedra porosa, que se deslocam lentamente na coluna de água, são mais eficientes a adicionar oxigénio à água do que bolhas de ar de grande dimensão ou pedras de aeração que se encontrem perto da superfície da água.

Os aquariofilistas devem tentar manter os níveis de oxigénio o mais perto da saturação possível. Sem um medidor para medir os níveis de oxigénio, a melhor forma de assegurar a saturação é o uso de um sistema de aeração. Não sobrepopular o aquário, nem alimentar excessivamente. Sifonar os detritos presentes do fundo do aquário e limpar os filtros mecânicos regularmente. Um medidor de oxigénio é um bom investimento, uma vez que pode verificar os níveis deste diariamente, e/ou depois de quaisquer tratamentos químicos/medicinais, ou, caso os peixes estejam a procurar oxigénio à superfície da água.